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实时荧光定量PCR(RT-PCR)实验代测
1.聚合酶链反应(英文全称:Polymerase Chain Reaction),简称PCR。聚合酶链反应(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火(复性)及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。它不仅可用于基因分离、克隆和核酸序列分析等基础研究,还可用于疾病的诊断或任何有DNA,RNA的地方.聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)又称无细胞分子克隆或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增技术。Real -Time PCR,即实时监测PCR扩增产物并进行解析的方法,它是在PCR反应体系中加入荧光物质,并通过Real -Time PCR检测系统对PCR反应进程中的荧光信号强度进行实时监测,zui终对实验数据进行分析处理的方法。Real -Time PCR自1996年由美国Applied Biosystems公司推出以来,广泛应用于生物研究的各个领域。目前主要有SYBR Green 染料、Taqman探针法两种。
实时荧光定量PCR(RT-PCR)实验代测
2 方法
2.1 组织总RNA的提取
(1)取组织或者细胞于1mL的Trizol的匀浆管中,于匀浆机匀浆20sec,立即放于冰上;
(2)置于超净台中,温育5min,12000r/min,离心10min;
(3)吸上清于新的1.5mL离心管中,加入200μL的氯仿,摇匀,室温静置2min,4℃,12000r/min,离心10min;
(4)吸取上清于新的1.5mL离心管中,加入600μL的异丙醇,混合均匀,室温静置15min,4℃,12000r/min,离心15min,弃上清;
(5)加入1mL75%的无水乙醇(750μL无水乙醇+250μL DEPC水)漂洗沉淀,4℃,12000r/min,离心5min,弃上清;
(6)加入1mL无水乙醇,漂洗沉淀,4℃,12000r/min,离心5min,弃上清,室温干燥10min;
(7)加入40μL的DEPC水溶解RNA,置于-80℃冰箱保存备用。
2.2 cDNA*条链的合成
2.2.1 总RNA中DNA的消除
DNaseⅠ: | 1μL | |
10×DNaseⅠ Buffer: | 1μL | |
总RNA: | ≦1ng | |
DEPC-H2O: | nμL | |
总体积: | 10μL |
37℃,30min;Hold,加1μL的EDTA;65℃,10min。
2.2.2 反转录
(1)按以下体系加入:
RNA-Primer Mix: | 12μL |
5×RT Reaction Buffer: | 5μL |
25mM dNTPs: | 1μL |
25U/μL RNase Inhibitor : | 1μL |
200U/μL M-MLV Rtase: | 1μL |
Oligo(dt)18 | 1μL |
ddH2O(DNase-free): | 4μL |
总体积: | 25μL |
反应程序:37℃,60min;85℃,5min;4℃,5min;置于-20℃保存。
2.3 Real-time PCR扩增
将制备好的cDNA进行PCR扩增,扩增体系如下:
SYBRGreen Mix 12.5μL
上游引物F 0.5μL
下游引物R 0.5μL
ddH2O 9.5μL
cDNA模板 2μL
总体积 25μL
反应程序:
95℃ ,10min(95℃,15Sec;60℃,45Sec)×40;95℃,15 Sec; 60℃,1min;95℃,15 Sec;60℃, 15 Sec;
数据采用仪器自带软件分析:ABI Prism 7300 SDS Software
实验结果
提供实验原始数据
cytochrome c mRNA扩增动力学曲线
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